علی خامنه‌ای، رهبر جمهوری اسلامی، در پیام تبریک خود به مسعود پزشکیان نوشت: «در دو جمعه پیاپی، انتخاباتی آزاد و شفاف برگزار شد.»
او افزود: «شایسته است رفتارهای رقابتی دوران انتخابات به هنجارهای رفاقتی تبدیل شود و هر کس در حد توان خود برای آبادانی مادی و معنوی کشور تلاش کند.»