بسیاری از زندانیان سیاسی در زندان‌های ایران، بدون رعایت اصل تفکیک جرائم در کنار زندانیان متهم به جرائم خشن نگهداری می‌شوند و با خطراتی همچون عدم امنیت جانی مواجه‌‌اند. موضوعی که با وجود هشدارها، همواره با بی‌تفاوتی مسئولان سازمان زندان‌ها و قوه قضاییه جمهوری اسلامی مواجه شده است.